《林中仓库》紧接S01E01 - 湾岸的幽灵。队伍刚从湾岸大桥的人造法尔希手中活下来，便被带进一件规模更小、也更难被城市看见的案子：灰点区的新生儿正被人掳走，归来后却像失去了对世界的反应。
从难民父母沉默的医院门前，到黑手党的生日宴，再到一座黯淡的冥碑，线索逐步把队伍引向林中仓库。藏在那里的是一名濒临失败的路希：她正试图用婴孩的身体，把一个死去的人带回来。
Darius 在撤离沿途持续入侵监控，使车队从摄像画面中直接消失。距离八月港卡姆登湾灰点区安全屋只剩约一百米时，前方路面却突然涌出一片无法看穿的黑雾，所有人只能停车。
雾散之后，西尔维娅·阿尔努特独自站在路上。布雷德终于见到失踪已久的妹妹，西尔维娅也没有预料到自己会在返回空间站的第一刻撞见兄长。
西尔维娅归来了，却已在施特拉德·冯·扎诺维奇的鸦阁魔域中成为吸血鬼。众人来不及问清经过，Darius 便催促他们先进入安全屋，以免刚从大桥撤离的行踪再次暴露。
进入安全屋后，Darius 提出下一份委托。八月港灰点区聚居着大量难民，教会、福利院和临时收容点也在这里为无家可归者提供住处与食物。空间站实行出生地主义；即使父母尚未取得合法身份，只要孩子出生在空间站，便从出生起成为空间站公民。
最近，多户难民家庭的新生儿遭人掳走。孩子通常会在一至两周后被送回，却持续高烧、不哭不闹，对声音、触碰和其他外界刺激也缺少正常反应。病例数量已经多到无法完全压下，新闻与医疗系统都知道有一批婴孩同时病了，却没有人知道他们离开家庭的那段时间经历了什么。
Darius 为调查开价十五万美元，但这次不会亲自带队。他还有其他事务，只提供安全屋与最初线索。经过一番争论，他同意先额外支付五万美元，作为上一项任务酬劳与本次委托订金，并交给队伍以下装备：
交代完毕后，Darius 独自驾车离开。队伍第一次必须在没有他持续引导的情况下，自己决定该去问谁、相信什么，以及怎样进入那些不欢迎调查者的地方。
Darius 留下的主要怀疑对象，是控制八月港难民偷渡与人口贩运网络的里奇家族和布鲁诺家族。
两支家族最清楚哪些偷渡者已经怀孕，也最容易在难民不敢报警的情况下接近新生儿。Darius 无法证明究竟是谁动手，却认为调查名单只能从这两家开始。
稍晚时，阿尔努特兄妹与父亲马库斯·阿尔努特进行视频通话。马库斯一方面终于确认女儿还活着，另一方面也必须接受她已经成为吸血鬼的事实。
布雷德表示，自己仍打算以当前方式伸张正义。西尔维娅的态度更直接：她信任哥哥，也愿意和他并肩行动，却不准备因为父亲担心便重新服从管教。她要继续冒险，也要找出当初把自己送入鸦阁魔域的吸血鬼法师团体。此时众人还不知道那群人名为维新法师集会。
马库斯没能说服任何一个孩子回家，最后只能要求他们尽可能确保安全，并承诺动用旧关系协助追查法师集会。随后，他与兄妹约定安全交接地点，把珍藏的两把枪交给他们：布雷德取得温彻斯特 M1894，西尔维娅取得伊萨卡 MAG-10 霰弹枪。
西尔维娅需要解决的并不只有追查仇人。若没有稳定血源与日照防护，她甚至无法像普通队员一样在白天行动。
奥因通过导师与研究院同僚联系新巴黎大学，得知校内正在培育一种能够提供人造血浆的血浆果。这种魔法作物原本服务输血、透析及其他医疗需求，并不是专门为吸血鬼准备。
研究人员紧急寄来样本。西尔维娅测试后确认，食用血浆果足以满足原本需要通过吸血缓解的身体需求。新巴黎大学同时提供了最新的强力防晒制剂；配合遮光装备后，她也能够在日光下正常活动。
有了稳定血源和日照防护，西尔维娅可以保留吸血鬼的身体，继续与队友一起在白天行动，也无须靠捕食他人维生。
同症状患儿主要集中在海山儿童医学中心。这所位于海山区的儿童专科医院兼具城市指定儿童急症中心职能，灰点区诊所、教会与福利院都会把无法处理的新生儿重症转送至此。
队伍抵达后，很快遇到与记者相同的阻力。部分父母根本不敢露面；聚集在医院外的人也大多拒绝评论。对他们而言，说明真相可能同时招来黑手党报复、身份审查与政府调查。即使孩子依法已经是公民，父母也没有因此获得对制度的同等信任。
一上午的询问只找到十几个愿意提供有效信息的家庭。综合证词后，队伍确认许多父母确实见过带走孩子的车辆，车身标识分别指向里奇或布鲁诺家族。若家庭原本通过里奇路线进入空间站，近期出现的车队通常也带有里奇家族特征；其他家庭暂时没有清楚规律。
父母若尝试追问去向，都会被拒之门外。孩子被送回后，他们又很难从忙乱的医院得到答案。住院部医护人员已经竭尽全力，却始终无法解释高烧与意识反应异常的共同病因。
外来调查者无法直接进入病房检查婴孩。西尔维娅于是使用荒野变形化作松鼠，沿通风管道进入住院区。
她靠近患儿后，听见他们以极微弱的声音发出深渊语。说话的并不是婴儿，而是一只被困在婴儿体内的判魂魔。
判魂魔原本生活在一处呈现人类所知地狱环境的遗迹中，正做着自己的事，却突然被某股魔法力量强行拖进陌生躯体。婴孩的感官尚未成熟，它又听不懂周围的人类语言，因此既不知道实验者身份，也无法解释自己被困期间发生了什么。它和婴儿一样，是这场仪式的受害者。
队伍原本以为需要复杂的驱魔或灵魂法术，最后却发现一个防护善恶便足以切断束缚。西尔维娅先对一名患儿施法；判魂魔被送回原处，离开前甚至向她道谢，孩子的状态也随即开始好转。
奥因立刻联络自己的研究院。导师麾下的学生与研究员可以把施展防护善恶当作受控实务训练，也能在不继续伤害患儿的前提下，观察一种空间站平时极难接触的异界生物。
奥因先在现场验证疗效，导师再与医院建立正式合作。法术简单、风险可控，使研究得以在救治患儿的过程中进行，无须让他们承受额外伤害。随后一周内，海山儿童医学中心收治的全部同症状患儿都得到治愈。
医院回答了“孩子为何生病”，却没有回答“谁把判魂魔放进去”。调查因此回到两支黑手党家族。
公开资料显示，里奇与布鲁诺家族的宅邸都位于港心区阿戈斯蒂尼高地。直接敲响任何一座豪宅的大门都不现实，AI Liam 于是从公开网络中筛出一个较软的入口：布鲁诺家族在同区经营的星港工业酒吧。
星期一晚，六人在这家工业风酒吧会合。多轮试探后，店员透露家族内部事务通常在楼上 VIP 房间处理。
西尔维娅还从服务员处问到一条与主案无关、却属于她自己的线索。此前有人来询问酒吧是否供应血浆调酒；简要追查显示，那些访客属于维新法师集会，之后便再未在酒吧出现。众人得知“维新”来自“维持新鲜”时，也第一次领教了这个吸血鬼团体的冷笑话。
奈亚贝斯与西尔维娅潜入楼上，偷听到凡·德罗西正在斥责几名底层成员。德罗西要求他们整理经布鲁诺路线进入空间站的孕妇与婴儿资料；几人不仅拒绝配合，还想绕过他向布鲁诺兄弟报告。
两名玩家尚未来得及干预，德罗西便命令副手开枪处决这几个人。奈亚贝斯与西尔维娅没有立即暴露，转而尾随运走尸体的车辆，想知道灭口之后还会留下些什么。
与此同时，诺艾尔从店员处得知，第二天是布鲁诺家族长兄、首脑阿尔菲诺·布鲁诺的生日。阿尔菲诺已经很久没有露面，家族却仍准备在宅邸举行盛大宴会，里奇家族主要成员也会出席。宾客若没有正式邀请函，就必须出示帮派成员身份证明。
德罗西的副手最终把尸体丢进卡姆登角垃圾站。奈亚贝斯与西尔维娅从死者身上取得帮派证件，又找到一枚外壳与接口几乎毁坏、数据芯片尚存的 U 盘。
奥因利用证件的数字信息侵入布鲁诺家族身份系统，把六名队员的资料加入成员名单。众人制作出可以通过检查的证件，并在安全屋恢复 U 盘内容。
文件把原本混乱的车辆证词接成了一条完整证据链：
这也解释了为什么部分父母记得“布鲁诺车辆”：至少一部分绑架由里奇家族伪装执行。被灭口的成员则很可能因为保存了足以证明德罗西背叛家族的资料而必须消失。
队伍决定使用伪造身份，进入第二天的生日宴。
布鲁诺宅邸院内摆满长桌，宾客享用意大利食物、蔬果与饮品。六人乔装入场，装备则被秘密带在身上。他们很快锁定了几位里奇兄弟与其他家族高层的位置，并在宴会真正开始前分配好各自应对范围。
阿尔菲诺始终没有出现。等待逐渐变成议论与焦躁，凡·德罗西和几名副手则各拿起一只橙子，走入布鲁诺兄弟所在的大厅，带着戏谑口吻追问家族首脑究竟去了哪里。
布鲁诺兄弟无法说出真相，只能含糊回应。德罗西随即摊牌与里奇家族的交易，拔枪指向他们；院内里奇成员也同时发动袭击。
队伍已经为这次背叛作好准备。奥因与 Junkboy 用法术、烟雾弹和闪光弹分割院内战场，阻断里奇成员彼此支援；奈亚贝斯和诺艾尔控制高处的魔炮无人机，阻止敌人驾车逃离。
布雷德与西尔维娅则突入宅邸。西尔维娅以法术控制室内局面，布雷德用冲锋与霰弹枪压缩敌人空间，兄妹的近距离火力很快结束对布鲁诺兄弟的直接威胁。
宾客与布鲁诺家族成员仍有伤亡，几名布鲁诺兄弟也不同程度受伤；但里奇家族与德罗西没能接管宴会。战斗结束后，队伍交出 U 盘证据，并要求兄弟们解释阿尔菲诺为何始终缺席。
布鲁诺兄弟没有继续隐瞒。他们带六人进入宅邸地下室最深处，打开一扇长期封闭的门。
门后，一具灰白的石质结构倒在地上。它勉强留有人形轮廓，与圆盘状碑体融为一体；表面的复杂纹路如同凝固的刻印，已经失去全部光芒与生命迹象。
兄弟们只说了一句：这就是阿尔菲诺。
阿尔菲诺留下的笔记记载，他曾在一处无法确认的位置遇见自称“法尔希”的存在。他当时不理解这个词意味着什么，只接收到一组意识流画面：杀死一名女性。随后，一道印记出现在他身上，并随着时间持续变化。
阿尔菲诺动用地下关系搜寻答案，最终买通第三街门徒，取得一份记载印记各阶段与最终结局的资料。这份知识最初由尼禄·杜卡斯从伯恩斯山发电站地下、夏诺克博士生前圣所的绝密档案中取得。
笔记使阿尔菲诺知道自己成为了路希，刻印属于法尔希·脉冲。使命中的女性正是阿梅雷达，完整要求则是杀死她，终止她掳走婴孩进行的实验。
阿梅雷达原本负责扩展亚玛教在八月港的信众基础。她使用意为“不灭”的教名，却已经在秘密调动里奇家族人口网络，为一项连阿尔菲诺也未能查明最终原理的实验取得婴孩；现有资料还暗示，这项实验并非完全出于她的个人行动，而曾得到亚玛教内部指示。
阿尔菲诺此前拒绝过阿梅雷达的合作条件，没有像里奇家族一样把难民家庭和婴儿资料交给她。这个选择也切断了双方联系。等他终于弄清使命内容时，已经无法继续获知阿梅雷达的位置，刻印也逼近最后阶段。
他知道使命失败后自己会化为失去人格的尸骸，于是把后事托付给弟弟们，独自将自己锁进地下室。他留下两项要求：绝不能让尸骸化的自己出去伤害他人；即使身在极道，也不要做违背良心的事。
两个多月后，尸骸已经耗尽力量并石化成冥碑。队伍看到的正是他失败之后留下的最后形态。
经营人口贩运的阿尔菲诺，最终拒绝了用别人的孩子换取自己完成使命的机会。这个选择没能救下他。布鲁诺兄弟却记住了这条底线，并希望有人接过他未能完成的事。
布鲁诺兄弟请求六人找到并杀死阿梅雷达，完成阿尔菲诺没能完成的事。报酬为一百万美元，以及布鲁诺家族今后的资源协助；其中二十万美元立即支付，既是预付款，也是对队伍在生日宴救下家族成员的谢礼。
兄弟们还愿意帮助队伍购买执照 +1 范围内的枪械与护甲。六人接受委托并更新装备，调查目标从“谁掳走婴儿”变成了“阿梅雷达究竟把实验藏在哪里”。
队伍调查黑手党期间，简·瓦德拉玛的新闻节目持续报道另一场危机。
新巴黎圣胡安限制区的地底水晶研究所自星期一中午起失去联络。设施深入地下二十五层，专门研究空间站水晶基座；此时队伍还不知道基座本身就是法尔希·伊甸。
研究人员无一回应，最早进入的搜救人员也相继失联。新闻最初只把它作为一场尚未查明原因的设施事故，队伍则忙于眼前的婴孩实验，没有理由在此时改变目标。
U 盘中的掳人车辆仍留下近期行踪。队伍追踪记录，最终把它们定位到红木镇林色乡村俱乐部附近：一栋原属红木镇购物中心、如今藏在林间的仓库。
生日宴火并失败后，里奇家族停止继续掳走婴孩。队伍无法确认这是因为损失过重，还是里奇与阿梅雷达暂时中止合作；但车辆最后汇集的位置已经足够让他们在星期四清晨发动突入。
仓库外围的守卫全是加入佣兵团的难民。阿梅雷达把他们安排在实验室最外层，一旦有人突入，最先交火的便是这些佣兵。
队伍没有与整个警戒圈正面开战。他们制造声东击西，把大部分佣兵引向一侧，再从后门进入。地下室入口的守卫携带FN M249；内层佣兵则使用包括H&K MP5SD5在内的军用级武器。
六人依靠潜行、陷阱法术和逐段推进解决守卫，并缴获机枪与部分武装。真正的实验室位于地下最深处。
队伍抵达内室前，阿梅雷达先一步冲了出来。她的路希刻印已经进入最后阶段，理智也被倒计时撕裂。她反复喊着：
我的时间就要到了，我完成不了使命了。燐世，我根本无法把博士的灵魂带回来！
阿梅雷达以灵能发动攻击。队伍此时还不知道她的刻印来自法尔希·燐世，只能看出另一个路希正像阿尔菲诺一样走到失败终点。
战斗中途，她彻底失去人形，转化为拥有四翼、能够飞行并投掷环刃的尸骸。六人最终击败尸骸，进入实验内室，找到尚未来得及被送回家庭的几名婴孩。他们分别施展防护善恶，把判魂魔送回原处。
阿梅雷达留下的资料说明，她使用的是一种名为“夺躯渡魂”（Transmigrate）的灵能。
这项能力与让死者原有身体复苏不同。它会把死者灵魂引入一名仍然活着、类别相同且足以承载对方的生物体内。死者灵魂必须自由并愿意返回；不愿成为容器的生者也可以抵抗。若灵能成功，回归者会以极虚弱状态醒来，并在随后一周逐渐把新身体改造成接近原本肉体的样子；容器原有的灵魂仍在体内，却失去对身体及原有能力的控制。
阿梅雷达试图以婴孩为容器，把提姆·达维特·夏诺克博士带回人世。她反复实验，却从未召回博士；被拖入孩子身体的始终是判魂魔。
当时队伍只能确认实验结果严重偏离目标，还不知道灵能究竟从何而来，也不知道博士是否愿意回来。对实验中的婴孩而言，这种技术差异没有改变一件事：阿梅雷达为了完成自己的使命，把无法表达同意的生命当成了可以反复替换的容器。
六人整理资料、准备把婴孩送回家庭时，突然接到布鲁诺兄弟的电话。对方只问他们究竟做了什么，并要求所有人立即返回宅邸。
地下室里的冥碑已经不再倒伏。它竖立、悬浮在空中，散发温和光芒。阿尔菲诺没有恢复人形，但布鲁诺兄弟相信，他感知到阿梅雷达已经死亡，未完成的使命终于由别人接过并完成。
兄弟们兑现总额一百万美元、资源协助与装备承诺，Darius 也支付了灰点区委托的剩余报酬。阿尔菲诺仍留在冥碑之中，队伍却完成了他最后未竟的使命。
当晚，简·瓦德拉玛再次播报地底水晶研究所消息。此时已有五支救援小队进入后失联，仍无人知道地下发生了什么。布克·波尔多已经抵达现场坐镇，并向全空间站招募有能力继续搜救的人，报酬高达三百万美元。
队伍在本篇章结束后提升至 4 级。他们刚刚从林间仓库救回婴孩，便决定前往新巴黎，接下这场已经吞没多支救援队的行动。S01E03 - 尘世之下由此开始。
S01E03 之后的一段时间，诺艾尔与尼禄见面。尼禄说明，夺躯渡魂最初由第三街门徒发现；他也曾委托他人尝试用相近方法带回博士，得到的答案却是博士本人不愿返回。
阿梅雷达后来窃取了灵能资料。她的实验为何没有因博士拒绝而直接失败，反而把判魂魔拖入婴儿身体，与第三街门徒掌握的结果完全不同。尼禄因此表示会亲自追查异常来源。
博士本人曾经拒绝归来，使阿梅雷达的实验多了一层残酷。她忙于对抗技术困难和使命倒计时，却没有为自己想要“拯救”的人留下拒绝的余地。
S01E01 以卡班库尔和人造法尔希打开战役，S01E02 则把镜头压到灰点区。受害者不是一座城市，而是一群合法身份脆弱、害怕警方与黑手党的父母；婴孩虽然依法是公民，家庭却仍没有足够力量要求制度给出答案。
这种缩小没有降低事件严重性。它说明神话技术并不只在大炮、法尔希和公开仪式中出现，也会沿人口贩运网络进入最难发声者的身体。
案件结构由一层层不对等关系组成。难民资料先被蛇头掌握，里奇家族再用伪装车辆嫁祸布鲁诺家族；凡·德罗西把底层成员灭口并准备出卖整个家族；阿梅雷达则站在所有这些网络之上，把孕妇、婴孩、佣兵和黑手党冲突都变成实验资源。
判魂魔的出现又使队伍重新判断谁在加害。它同样被强行拖进婴儿身体，一个低环防护法术就能让双方一同获救。查清束缚从何而来，才使调查者找到真正应当制止的人。
西尔维娅的归队不只是增加一名战斗成员。她的吸血鬼身份带来血浆果与维新法师集会线索，荒野变形与深渊语又直接破解医院病因；奥因把一次发现扩展为医院与研究院合作；Liam 与奥因破解身份和 U 盘；诺艾尔、奈亚贝斯和 Junkboy 的无人机、黑客与战场控制则让生日宴从一场正面火并变成预先布防的协同作战。
Darius 在本章主动退到场外。队伍不再只按一份坐标清除目标，而是自行决定从医院、酒吧、尸体、证件和车辆记录之间建立证据链。这也是他们从临时受雇者变成独立行动小队的一步。
阿尔菲诺与阿梅雷达都被使命逼到人形终结。阿尔菲诺并不善良，却拒绝用婴孩交换自己完成使命的机会，并主动把即将失控的尸骸锁起来；阿梅雷达自认在挽回博士，却不断剥夺婴孩、判魂魔乃至博士本人的意愿。
两人都没有完成使命，却在最后的选择中留下了不同的后果：阿尔菲诺要求弟弟们守住良心，自己锁门等待失控；阿梅雷达继续夺取他人的身体，留下了一批需要别人救治、送回家的婴儿。
冥碑最终发光，阿尔菲诺却没有复生。这个结局保留了路希使命的残酷，也让后来者的选择有了分量：受印者倒下以后，仍有人决定接过他未竟的事。
地底水晶研究所失联消息从星期一开始穿插在调查中。它没有抢走眼前案件的优先级，却在结尾从背景噪声变成三百万美元的公开求援。前一章由 Darius 组织队伍，本章让队伍学会自行调查，下一章便把他们送入一个外部情报几乎完全失效的地下设施。
一周目的相近剧情没有把任何 NPC 设为路希，也没有让玩家深度介入两支黑手党家族的内部冲突。队伍主要通过连续数日追踪帮派车辆，直接定位阿梅雷达的仓库。
旧版同时包含更多城市支线。S01E01 使魂仪式所用的暗水晶当时没有消失，玩家因此前往新巴黎赌场，与新巴黎大学的买家完成研究材料交易；他们在赌场看见尼禄以复制能力“以牙还牙”轻松反制刺客，也发现雷参加活动，并在事后驾驶红黑 Audi R8 返回红木镇的克雷格家族宅邸，由此推测 Darius 的真实身份。
玩家还曾通过红木大学附近的飙车活动结识校内亚玛教信徒，继而参加阿梅雷达主持的礼拜，亲眼看见她以灵能杀死所谓叛教者来强化威望。旧版最终战中，阿梅雷达不是路希，尼禄也亲自参战，并复制能力独自解决实验室自动炮台。
二周目删去或转移这些周边事件，把帮派背叛、阿尔菲诺冥碑、判魂魔与阿梅雷达尸骸集中到同一条调查线上。改编后的神话信息不再在结尾突然出现，而是从医院异常、U 盘实验对象、地下室刻印与两名路希的失败逐步显形。
“林中仓库”直接指向红木镇林间的实验设施，也轻微致意电影 The Cabin in the Woods 所使用的“偏僻林地表象之下隐藏地下设施与仪式”的恐怖类型结构。
血浆果的名称与吸血鬼食物用途来自《The Sims》系列的 Plasma fruit。巴别空间站将它改写为先服务输血与透析、后来才发现吸血鬼用途的医疗魔法作物。
凡·德罗西一行在摊牌前各自拿起橙子，致意《The Godfather》系列中橙子与暴力、死亡预兆相连的画面传统。
路希、尸骸、冥碑、脉冲与燐世来自《Final Fantasy XIII》及新水晶神话。二周目把这些概念嵌入黑手党与人口网络，使使命不只属于抽象神话，也会直接重写一个家族首脑和一名传教者的结局。
“夺躯渡魂 Transmigrate”来自 D&D 3R 第三方灵能扩展《Hyperconscious: Explorations in Psionics》。本章只采用其核心结构：以活体容器承载愿意返回的死者灵魂，并让新灵魂逐渐改造躯体。