有灵魂的生命由三种相互关联的结构维系：灵魂使生命跨越轮回而保持连续，心灵形成这一世具体的人，躯体让生命在可视世界中感知和行动。三者各自承担不同作用，保存其中之一，并不保证其余两者也能留存。
“灵魂承载心灵”说明它们在生命与轮回中的关系。灵魂与心灵没有可供解剖确认的固定内外位置，也不能按器官及其容纳物来理解。
灵魂是心灵的容器，也是一个生命跨越不同轮回仍保持不变的唯一标识。它说明生生世世之间为何仍可被称作同一个生命，却不保存这一世完整的性格、记忆、关系与思想。
灵魂若在通常死亡中离开躯体，会进入不可视世界等待下一次轮回。若灵魂本身遭到彻底毁灭，这个生命便不再拥有下一世；任何保存肉体、复制记忆或模拟人格的手段，都不能自行恢复已经消失的唯一标识。
心灵是由混沌赋予的一世结构，包含情感、人格、记忆关系、自我认同，以及使这一世的个体成为“这个人”的全部复杂性。
生命活着时，灵魂承载着属于这一世的心灵。一个存在能够接触、移动甚至复制灵魂，不代表它也能完整观察或重建心灵；保存灵魂也因此不必然等于保存原本那个人。
死亡后，心灵回归不可视世界的混沌。下一次轮回中，同一灵魂会从混沌取得一份新的心灵。因此，灵魂可以保持连续，而前后两世仍拥有完全不同的性格、愿望与人生。
躯体是生命从可视世界取得的物质形态。它让灵魂与心灵能够感知环境、采取行动，也决定这一世会以怎样的生理条件被外界认识和伤害。
躯体死亡会启动通常的死亡过程，却不等于灵魂已经毁灭。反过来，让躯体继续活动、把记忆写入另一具身体，或用魔法重构遗体，也不能单独证明原本生命已经回来。
通常死亡发生后，心灵回归混沌，灵魂进入不可视世界等待轮回。下一世开始时，同一灵魂从混沌取得新的心灵，并从可视世界取得新的躯体。
轮回由此延续了生命的唯一标识，却会更替一世的人格。人与上一世共享同一个灵魂，也不会自然继承上一世的记忆、立场或社会关系。
艾特罗曾负责约束混沌并维持这套循环；她消散后，凯亚斯·巴拉德继承混沌的心脏，接替了不可视世界中的职责。
舍沙把这套区别变成了可以被实验验证的事实。它吞噬灵魂后，受害者永久失去轮回可能；其排出物仍携带少量此世记忆与认知残余，却既不是幸存的灵魂，也不是完整心灵。以此制造的记忆强化药剂能够帮助另一个人记住，却不能让原本生命回来。
阿梅雷达的夺躯渡魂实验则试图把死者灵魂移入活体容器。即使法术能够成立，它仍然会抹去或压制容器原有生命，并迫使新的身体围绕外来灵魂重构；这不是无损复活，而是让“谁的灵魂、谁的心灵、谁的身体”成为一场无法回避的伦理冲突。
强烈而持续的羁绊也可能让此世心灵在可视世界留下残留结构。它既不是完整心灵，也不让灵魂停留在人世；却可以成为指向同一段人生的锚点，使复活手段召回原本灵魂时，已经回归混沌的原本心灵仍有机会沿这份共鸣被牵引和重组。拉撒路计划把死者与武器的长期联系用于这种复活：武器不能复制死者，却能帮助同一个人找到返回这一世的路径。
武器人类改造计划第一、第二代中从武器直接创造生命的路线，则建立新生命诞生的条件：一份进入这一世的灵魂从混沌取得新的心灵，与类人躯体和原本武器共同构成生命。这个过程没有召回死者，也没有重组或复制既有人格；诞生者从一开始便是一个新的人。
使魂等人造神性生命又提出另一层问题：一套结构能够短暂获得行动、使命和神力，并不自动证明它已经拥有成熟心灵。灵魂、心灵与躯体的区分，因而也是判断克隆、战术人形、人工法尔希与复活实验究竟保存了什么的基础。
这里的“心灵”对应日语 kokoro，同时涉及心念、情感、人格与内在自我，难以稳定地由一个西方语言词汇完整对应。相关翻译问题可参见 Correcting the biggest translation error in the Final Fantasy XIII series，也可对照 Final Fantasy Wiki 对 Heart 与 Afterlife 的整理。
战役以中文进行，正文因此统一使用“心灵”指代这一世的内在结构，并把“灵魂”留给跨越轮回的唯一标识。这里的“心灵”也不是 DND 规则里所有精神、意识或灵能效果的泛称。
不同原作文本与译本对灵魂和心灵谁“位于”谁之中的表述并不完全一致。巴别空间站采用功能性的转译：灵魂在一世中承载心灵，死亡后保留生命连续性，再于下一轮回承载一份新的心灵；除此之外，不把两者写成方向固定的灵魂解剖学。