方舟是一座能够在不可视世界中庇护生者的小型神迹。阮唐随它进入混沌，躲过上一周目的抹消，并在 S01E05 与本周目的玩家队伍相遇。
其创造者、原本用途，以及那股神秘力量为何选择阮唐，均尚不明确。
上一周目世界被除尘毁忆抹消前，一股神秘力量把阮唐投入方舟，并将两者一同送入不可视世界。复仇者之盾也随他进入。
上一周目的存在、记忆与因果随之被连锁抹去，阮唐与随身物品却在方舟中留存下来。故乡已经消失，他只能在不可视世界中等待，直到与2周目的生命相遇。
从阮唐的经历可以确认，方舟的内部环境能够阻挡混沌对生者身体与灵魂的致命侵蚀。身处其中时，阮唐无需吃喝便可维持生命，也没有继续衰老。
等待期间，阮唐偶尔会毫无征兆地跳过一段时间。他无法选择跳跃的起止，也因此没有逐分逐秒地经历整个等待过程。
雷·克雷格从半位面建立通往不可视世界的门，并大致定位方舟。布雷德、诺艾尔、Junkboy与凯亚斯进入后，在那里见到阮唐；阮唐随后负责驾驶，带领众人寻找尤里。
队伍把正受混沌侵蚀的尤里带入其中，又在艾特罗消散、混沌风暴形成后尝试返回传送门。混沌巴哈姆特的百万核爆使大部分成员濒死，方舟仍为他们提供了能够接受紧急救治的安全区域。
混沌风暴使雷的定位失效，众人在不可视世界迷失三个月，最终才重新找到西尔维娅与雷守候的半位面入口。方舟由此把阮唐与本周目队伍一同带回可视世界。
方舟也曾在国度天宇的周目转换中提供庇护。FR二周目的雷·克雷格、提贝里乌斯·亚瑟雷欧与安缇诺雅·嘉兰诺德借此越过原本世界的毁灭，抵达3周目-新FR团所在的国度天宇。
阮唐与这些国度天宇幸存者的经历表明，方舟能够在不同世界链遭到毁灭时保存生命，使幸存者延续原有的身份与经历。
方舟采用《圣经》中诺亚方舟保存生命、使其跨过灭世洪水的意象。巴别空间站把洪水替换为不可视世界的混沌与除尘毁忆造成的世界抹消，让生命及其记忆能够越过本应抹去一切的灾难。